Hasta 1936 los servicios oficiales de salud estuvieron a cargo del Ministerio del Interior.Antes, solo existían el Hospital Militar y el Hospital de Clínicas a más de la Asistencia Pública.En el interior, solo en 4 departamentos existían hospitales y algunos puestos de salud.
Como los heridos y mutilados que vinieron del frente de batalla representaban un gran problema sanitario que requería de una institución que se encargase de ellos, se crea el Ministerio de Salud, a consecuencia de la guerra del Chaco. Según el relato del Dr. Pedro Duarte Ortellado, algo había que hacer para solucionar los graves problemas sanitarios que representaban los heridos y mutilados que vinieron del frente de batalla. En Carandayty, le planteó el tema al Coronel Rafael Franco con estas palabras: “Coronel, la guerra tiene que terminar pronto y vamos a tener muy graves problemas de orden sanitario. Los heridos y mutilados que hay que seguir tratando necesitaran de instituciones que se encarguen de ellos. Pero tendremos problemas mucho más graves de orden sanitario que son los miles de enfermos que han ido de la Región Oriental llevando enfermedades del Chaco: paludismo, disentería, tifoidea, y otras, a parte de la desnutrición, la avitaminosis y otras patologías”. Fue así que se forma una comisión encargada de crear las bases para conformar un nuevo Ministerio, liderado por el Dr. Pedro Duarte Ortellado designado Director Nacional de Higiene y Asistencia Pública y, con el apoyo de los doctores más prominentes de la época, tales como Carlos Gatti, Max Boettner, Ramón Giménez Gaona Battilana, José Insfrán, Julio Manuel Morales y otros, para la redacción de la Ley de Salud Pública, la Carta Orgánica y el Plan de Salud Pública del nuevo Ministerio. El 15 de junio de 1936, el Gobierno Provisional de la República, promulgó el Decreto - Ley Nº 2.000, que crea el Ministerio de Salud Pública con rango de Secretaría de Estado, designando al Dr. Pedro Duarte Ortellado Ministro Secretario de Estado en dicha Cartera. Su Carta Orgánica fue creada por Ley No. 2001 del 15 de junio del mismo año. Así se instituye el servicio sanitario de la República para promover la salubridad general y proveer asistencia médica a la población de todo el país, y se le otorga al Ministerio la organización y administración del Servicio Sanitario de la República. La creación del Ministerio de Salud convierte al Estado paraguayo en tutor de la salud de la población. El nuevo organismo sanitario ejerce una serie de funciones: de policía sanitaria y de las profesiones vinculadas a las prestaciones de servicios y de normatización y control. • Estructura organizacional del Ministerio de Salud (1936). • Dirección de Higiene y Salubridad Pública. • Dirección de Beneficencia y Dirección de Lucha Antituberculosa. Estas Direcciones luego se consolidaron y formaron el Departamento de Higiene y Beneficencia con las siguientes divisiones: • Malaria. • Asistencia Pública (Hospitales, Unidades Sanitarias y Dispensarios). • Bioestadística y Educación Sanitaria. • Lucha Antituberculosa. Decreto Ley por el cual se crea el Ministerio de Salud Pública La Carta Orgánica del Ministerio de Salud fue creada por Ley Nº 2001 del 15 de junio de 1936. Visto el Decreto Ley No. 2.000, por el cual se crea el Ministerio de Salud, y siendo necesario dictar la Ley Orgánica respectiva; el Presidente Provisional de la República, oído el parecer del Consejo de Ministro, Decreta con fuerza de Ley, la adopción de la Ley Orgánica de Salud Pública para el funcionamiento del Ministerio creado por Decreto Ley No. 2.001, de esta misma fecha. La Ley Orgánica adoptada para el funcionamiento del Ministerio instituía así el Servicio Sanitario de la República del Paraguay, para promover la salubridad general y proveer de asistencia a la población en todo el país. El Art. 3º de este Decreto Ley, asigna al nuevo Ministerio “La organización y administración del Servicio Sanitario de la República”. Este Decreto Ley Nº. 2.001 consta de XII Capítulos y 62 Artículos; y lleva la firma de Rafael Franco, entonces Presidente Provisional de la República, y de los integrantes del Consejo de Ministros: Juan Stefanich, Germán Soler, Emilio Gardel, B. Caballero y Pedro Duarte Ortellado. En sus inicios, el Ministerio de Salud funcionaba en un edificio ubicado sobre Palma esq. Montevideo, pero pronto surgió la necesidad de contar con un edificio propio. La Municipalidad de Asunción le cedió al Ministerio un terreno ubicado en la intercepción de la Avda. Pettirosi c/ Brasil. El Decreto-Ley Nº 16.514, del 13 de enero de 1943, autoriza a la Municipalidad de la Capital a transferir al Ministerio de Salud un solar municipal para la construcción de un” gran edificio central” en consideración a su ubicación estratégica y por haber sido elegido por la Comisión de Cooperación Interamericana de Salud Pública como lugar más adecuado. La sede edilicia fue construida por el SCISP en cumplimiento del “Programa de Cooperación para la Salud Pública” entre los gobiernos de Paraguay y de los Estados Unidos de América. Características arquitectónicas del edificio Único en su género, el edificio es obra del Arquitecto Roger Ayala – uno de los principales exponentes de la Arquitectura Moderna en el Paraguay y del constructor Nicolás Korsakoff. En la parte superior de la pared del lado frontal, lleva la inscripción en latín: “Salus populi suprema lexs est.” (La salud del pueblo es la suprema ley). El edificio está dispuesto en forma de “U” y consta de dos plantas y sus galerías, de techos de tejas soportadas por pilares cuadrangulares, rodean a un patio central con árboles y arbustos que mantienen la frescura y permiten la integración y realización de las actividades al aire libre. Debido al desnivel del terreno, un sector del edificio posee un tercer nivel al que se le considera sub suelo, pero que en realidad está al nivel de la calle Brasil. Posee accesos independientes sobre las calles Pettirossi y Fulgencio R. Moreno, así como también uno de servicio hacia la calle Brasil. Funcionalmente, fue diseñado y construido para albergar Servicios Asistenciales hospitalarios, pero en la actualidad el edificio es utilizado en su totalidad como administrativo, lo cual requirió readecuaciones que desvirtuaron su lenguaje original. Es un edificio de carácter monumental, de valor arquitectónico singular, por ser el único que conserva la transición en el paso del neoclásico tardío y el modernismo incipiente que se va a consolidar una década después. Este edificio público fue considerado entonces como el de mejor esquema o planta de funcionamiento. Las sucesivas modificaciones del que fue objeto cambiaron su distribución topológica funcional original, en el afán de mantenerlo de acuerdo a disponibilidades y adecuarlo a necesidades – intervenciones irreversibles que lo han desvirtuado de su concepción original, tal como colocaciones de alfombras o vinílicos o pisos cerámicos sobre los originales o sustitución directa de estos, cambio de aberturas originales, modificaciones físicas y otras más. Dada su importancia, debe ser conservado funcional y formalmente, respetando su tipología y morfología inicial. En el año 1945, fue inaugurada la sede edilicia del Ministerio de Salud, en el gobierno del General de División Higinio Morínigo, siendo Ministro de Salud Pública y Previsión Social, el Coronel de Sanidad Dr. Gerardo Buogermini, y contó con la asistencia del Director del Servicio Cooperativo Interamericano de Salud Pública, del Dr. Richard Plunkett y del Ingeniero Jefe Jobin W. Guenleaf Jr. También lo hicieron el General Duhnan, médico jefe del Servicio de Salud americano, y de otras personalidades. La bendición del nuevo edificio estuvo a cargo del Monseñor Sinforiano Bogarín. En esa oportunidad, todos los diarios capitalinos destacaron con grandes titulares en primera página, dicho evento, presidido por el Presidente General Higinio Morínigo, como “…un aporte del Paraguay nuevo a la defensa de la salud del pueblo”. Como hecho anecdótico se destaca que la fecha de inauguración del edificio debía coincidir con el Día Mundial de la Salud, que es el 7 de abril pero, como ese día era domingo, se adelantó para el viernes 5 del mismo mes y año.