La Zona IX Paraguarí se creó en el año 2004 con sede en la ciudad de Paraguarí. El primer jefe fue el Sr. Emigdio Antonio Martínez y cuenta con 29 funcionarios.
La Zona IX se divide en 2 sectores:
Sector 1 Paraguarí
Sector 2 Carapegua
Las patologías que combate la zona son:
- Chagas
- Dengue