PROGRAMA NACIONAL DE DETECCIÓN NEONATAL/ PROGRAMA NACIONAL DE PREVENCIÓN DE LOS DEFECTOS CONGÉNITOS.
· PROGRAMA NACIONAL DE ATENCIÓN A PACIENTES OSTOMIZADOS (PRONAPO)
· PROGRAMA NACIONAL DE ATENCIÓN INTEGRAL PERSONAS CON ENFERMEDADES LISOSOMALES (PAIPEL)
· PROGRAMA NACIONAL DE ATENCIÓN INTEGRAL A LOS TRASTORNOS DEL ESPECTRO AUTISTA (PNAITEA)
· DIRECCIÓN DE GÉNERO
· DIRECCIÓN DE ANATOMÍA PATOLÓGICA
· DIRECCIÓN DE SALUD INTEGRAL DE LA NIÑEZ Y ADOLESCENCIA (DRISINA)
· DIRECCIÓN DEL PROGRAMA DE SALUD SEXUAL Y REPRODUCTIVA (DSSyR)
· DIRECCIÓN DE LOGÍSTICA
· DIRECCIÓN DE FORMACIÓN, MONITOREO Y GESTIÓN DE PROYECTOS
· DIRECCIÓN ADMINISTRATIVA DE PROGRAMAS
· COMITÉ TÉCNICO NACIONAL DE VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA DE MORBIMORTALIDAD, MATERNA Y NEONATAL (CTNVEMMMFyN)