La Zona III Cordillera tiene por sede la ciudad de Caacupé y cuenta con 31 funcionarios. Abarca 20 distritos con una superficie de 4948 km2 y 233.854 habitantes.
Se encuentra dividido en dos sectores, cuyos jefes son: el Sr. Blas h. León Gauto en el Sector 1 Caacupé y el Sr. Trigidio Laneri Miranda en el Sector 2 Eusebio Ayala.
En el año 2004 el jefe de la zona fue el Sr. Ernesto Enciso, precedido el 5 de abril de 2006 por el Téc. Sup. en Vigilancia Entomológica Ricardo Pastor Guido Rivas .
Sector 1 Caacupé abarca 10 distritos que son:
- Caacupé
- Altos
- Atyrá
- Arroyos y Esteros
- Emboscada
- Loma Grande
- Nueva Colombia
- Juan de Mena
- San Bernardino
- Tobatí
Sector 2 Eusebio Ayala abarca 10 distritos que son:
- Eusebio Ayala
- Caraguatay
- Piribebuy
- Isla Pucú
- San José Obrero
- 1º de Marzo
- Itacurubi de la Cordillera
- Valenzuela
- Santa Elena
- Mbocayaty del Yhaguy
Las patologías prioritarias del departamento son:
- Chagas
- Dengue
- Leishmaniosis Visceral
Dirección: Juan León Mallorquín c/ Intendente Ortiz nº 1224
Teléfono: 051.242.001
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